Cours 2017-2018

Microbiologie [SVETB310]

  • 3 crédits
  • 35h+15h
  • 1er quadrimestre
Langue d'enseignement: Français
Enseignant: Gillet Nicolas

Objectifs

Le cours de microbiologie aura pour objectif de fournir les connaissances fondamentales en décrivant les microorganismes au niveau moléculaire. Nous nous intéresseront aux virus, aux bactéries et archées ainsi qu’à certains agents infectieux ‘inhabituels’ comme les prions.

La structure des cellules microbiennes sera décrite en distinguant les 3 domaines que sont les archées, les bactéries et les eucaryotes. Le métabolisme microbien sera exposé en partant de principes fondamentaux de physique et de chimie. L’extraordinaire diversité du catabolisme bactérien sera mise en parallèle avec la multitude d’écosystèmes colonisés par les microbes. L’étude de l’anabolisme illustrera l’universalité des voies de biosynthèse des macromolécules. La description de la génétique microbienne et notamment des mécanismes de variations constituera la base moléculaire des phénomènes de résistance aux agents antimicrobiens. Les méthodes de prophylaxies et de lutte contre les infections seront exposées.

La seconde partie du cours décrira le cycle viral, de l’entrée du virus dans l’organisme hôte à l’infection d’un nouvel individu en passant par le détournement de la machinerie cellulaire et la subversion de la réponse immune. Les différents taxons seront détaillés notamment durant l’exposition des mécanismes de réplication du génome viral.

Contenu

Les bactéries

Les archées

Les eucaryotes unicellulaires

Introduction au métabolisme microbien

Réaction d’approvisionnement, le catabolisme

Utilisation de l’énergie pour la biosynthèse, l’anabolisme

Recyclage biogéochimique

Croissance microbienne

Contrôle des microorganismes dans l’environnement

Chimiothérapie antimicrobienne

Génétique bactérienne et résistance aux antibiotiques

Infection et pathogénicité bactérienne

Introduction à la virologie

Le cycle viral

Génome et génétique virale

Structure de la capside et de l’enveloppe

Attachement et entrée du virus

Synthèse de l’ARN viral à partir d’un modèle ARN

Transcription et maturation de l’ARN viral

Réplication du génome des virus à ADN

Transcriptase inverse et intégrase

Traduction

Assemblage, sortie et maturation du virion

Agents infectieux inhabituels

Antiviraux

Evolution des virus

Maladies virales émergentes


Pré-requis

Biochimie générale I [SBIOB210] et Génétique [SBIOB213] et Diversité et évolution animale II [SBIOB201]

Méthodes d'enseignement

Cours ex cathedra avec projections de powerpoints.

Capsules vidéo reprenant certaines notions clé.

Mode d'évaluation

Examen portant sur la matière vue au cours et dispensée pendant les travaux pratiques.

L'évaluation (note sur 20) constitue la somme des 2 épreuves (section vétérinaire : 16 points pour l'examen théorique, 4 points pour l'évaluation des travaux pratiques ; section biologie : 18 points pour l'examen théorique, 2 points pour l'évaluation des travaux pratiques) si et seulement si les 2 épreuves sont réussies avec une note individuelle supérieure à 9/20.

L’examen sur la partie théorique est un oral avec préparation écrite. Les étudiants disposent d’un temps de préparation de +/- 30 minutes. Le professeur interroge seul. L'examen dure environ 15 minutes.

Sources, références et supports éventuels

Principles of Virology, 4th edition, Flint, Racaniello, Rall and Skalka, ASM press, ISBN 978-1-55581-9514

ViralZone, http://viralzone.expasy.org/

Prescott’s microbiology, 10th edition, Willey Sherwood and Woolverton, Mc Graw Hill education, ISBN 978-1-259-28159-4

Veterinary Microbiology and Microbial Disease, 2nd edition, Quinn, Wiley-Blackwell, ISBN-13: 978-1405158237

Langue d'enseignement

Français

Lieu de l'activité

NAMUR

Faculté organisatrice

Faculté des sciences
Rue de Bruxelles, 61
5000 NAMUR

Cycle

Etudes de 1er cycle