Cours 2020-2021

Microbiologie [SVETB310]

  • 3 crédits
  • 35h+15h
  • 1er quadrimestre
Langue d'enseignement: Français
Enseignant: Gillet Nicolas

Objectifs

Ce cours a pour objectif de faire découvrir la vie à l’échelle ‘micro’.

Nous nous intéresserons aux virus, aux bactéries, aux archées et aux eucaryotes microbiens.

La structure des cellules microbiennes sera décrite en distinguant les 3 domaines que sont les archées, les bactéries et les eucaryotes. Le métabolisme microbien sera exposé en partant de principes fondamentaux de physique et de chimie. L’extraordinaire diversité du catabolisme bactérien sera mise en parallèle avec la multitude d’écosystèmes colonisés par les microbes. L’étude de l’anabolisme illustrera l’universalité des voies de biosynthèse des macromolécules. La description de la génétique microbienne et notamment des mécanismes de variations constituera la base moléculaire des phénomènes de résistance aux agents antimicrobiens. Les méthodes de prophylaxies et de chimiothérapie antibiotique seront exposées.

La seconde partie du cours décrira le cycle viral, de l’entrée du virus dans l’organisme hôte à l’infection d’un nouvel individu en passant par le détournement de la machinerie cellulaire et la subversion de la réponse immune. Les différents taxons seront détaillés notamment durant l’exposition des mécanismes de réplication du génome viral. Finalement, différentes stratégies antivirales seront exposées.

Contenu

Les bactéries

Les archées

Les eucaryotes unicellulaires

Introduction au métabolisme microbien

Réaction d’approvisionnement, le catabolisme

Utilisation de l’énergie pour la biosynthèse, l’anabolisme

Culture et identification microbienne

Contrôle des microorganismes dans l’environnement

Chimiothérapie antimicrobienne

Génétique bactérienne et résistance aux antibiotiques

Infection et pathogénicité bactérienne

Introduction à la virologie

Culture et identification des virus

Génome et génétique virale

Structure de la capside et de l’enveloppe

Attachement et entrée du virus

Synthèse de l’ARN viral à partir d’un modèle ARN

Transcription et maturation de l’ARN viral

Réplication du génome des virus à ADN

Transcriptase inverse et intégrase

Traduction

Assemblage, sortie et maturation du virion

Evolution des virus

Antiviraux


Pré-requis

Biochimie générale I [SBIOB210] et Génétique [SBIOB213] et Diversité et évolution animale II [SBIOB201]

Méthodes d'enseignement

Cours ex cathedra avec projections de powerpoints.

Capsules vidéo reprenant certaines notions clés.

Travaux pratiques obligatoires.

 

Mode d'évaluation

Examen écrit portant sur la matière vue aux cours théoriques et dispensée pendant les travaux pratiques.

 

Sources, références et supports éventuels

Principles of Virology, 4th edition, Flint, Racaniello, Rall and Skalka, ASM press, ISBN 978-1-55581-9514

ViralZone, http://viralzone.expasy.org/

Prescott’s microbiology, 10th edition, Willey Sherwood and Woolverton, Mc Graw Hill education, ISBN 978-1-259-28159-4

Veterinary Microbiology and Microbial Disease, 2nd edition, Quinn, Wiley-Blackwell, ISBN-13: 978-1405158237

Langue d'enseignement

Français

Lieu de l'activité

NAMUR

Faculté organisatrice

Faculté des sciences
Rue de Bruxelles, 61
5000 NAMUR

Cycle

Etudes de 1er cycle