Structures des macromolécules [SCHIM213]

Acquis d'apprentissage

Familiariser l'étudiant avec la structure tridimensionnelle (3D) des protéines, la détermination expérimentale de cette structure 3D ainsi que les méthodes de prédiction de la structure 3D. La manipulation des protéines (ingénierie des protéines) sera aussi abordée, à l'aide d'exemples issus de la littérature et/ou de l'intervention d'orateurs externes.

Objectifs

A l'issue du cours, les étudiants maitriseront les concepts liés à la structure d'une macromolécule biologique, seront capables de comprendre de façon critique un article scientifique, sauront synthétiser et présenter des résultats.

Contenu

Le cours sera constitué de :

- une partie relative aux techniques expérimentales de détermination de la structure de macromolécules biologiques,

- une partie relative aux approches théoriques de modélisation de macromolécules biologiques.


Outre un ensemble de concepts théoriques, une mise en pratique sera proposée sous forme de tutoriel(s). Un rapport sera remis à une date fixée par les enseignants et servira de base pour l'examen.

Table des matières

- Description succincte des thèmes abordés

Interactions physiques au sein des protéines et contributions énergétiques qui permettent le repliement et la stabilité de la structure repliée des macromolécules biologiques. Des notions telles que les « champs de force » seront également abordées.

Techniques expérimentales de détermination de la structure de macromolécules biologiques. Des méthodes physicochimiques permettent de proposer un modèle de la structure tridimensionnelle d'une protéine. Ces méthodes sont notamment la diffraction de rayons X sur cristaux de protéines et la résonance magnétique nucléaire. D'autres approches, telles que la fluorescence et le dichroïsme circulaire, permettent également de caractériser la structure d'une protéine.

Approches théoriques de modélisation de macromolécules biologiques