Protein Structure and Function [SBIOM134]

Acquis d'apprentissage

Dans de nombreux exemples de mécanismes moléculaires, la structure tridmensionnelle des protéines permet d'expliquer des processus essentiels tels que la liaison de partenaires, la catalyse ou l'allostérie. Au terme du cours, l'étudiant(e) doit être capable d'analyser une structure tridimensionnelle de protéines, d'avoir une attitude critique quant à la validité de la structure proposée, et être familiarisé avec les techniques de détermination et de prédiction de la structure tridimensionnelle des protéines.

Objectifs

Familiariser l'étudiant avec la structure tridimensionnelle (3D) des protéines, la détermination expérimentale de cette structure 3D ainsi que les méthodes de prédiction de la structure 3D. La manipulation des protéines (ingénierie des protéines) sera aussi abordée, à l'aide d'exemples issus de la littérature et d'orateurs externes.

Contenu

Approches expérimentales et théoriques liées à la modélisation de la structure 3D des protéines. Limites et possibilités de manipulation des protéines.

Table des matières

- Rappels (structure 3D des protéines)

- Détermination de la structure 3D d'une protéine (DRX, RMN) : concepts, applications et exemples

- Prédiction de structure 3D

- Les changements de conformation

- Prédiction de la fonction des protéines

- Structure 3D des protéines membranaires

- Ingénierie des protéines

Description des exercices

Un TP sur la cristallisation d'une protéine et l'analyse initiale d'une diffraction de rayons X est proposée

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