Cours 2019-2020

Techniques avancées de biologie cellulaire et moléculaire [SBIOM101]

  • 3 crédits
  • 30h
  • 1er quadrimestre
Langue d'enseignement: Français

Acquis d'apprentissage

Familiariser l'étudiant avec les approches expérimentales utilisées dans les laboratoires de recherche dans le domaine de la biologie cellulaire et moléculaire, et de la transgenèse. Un accent particulier sera mis pour soulever les avantages et les limites des techniques illustrées, pour stimuler l'esprit critique de l'étudiant. L'étudiant devra donc être capable, face à une question biologique donnée, d'établir une stratégie expérimentale visant à y répondre.

L'étudiant devrait être capable, face à une question biologique donnée, de proposer et critiquer des approches techniques et expérimentales visant à l'étudier.

 

Objectifs

Décrire et expliquer les avantages et les limitations de nombreuses techniques modernes de biologie moléculaire et cellulaire utilisées en génétique et en biochimie, pour les cellules eucaryotes ou procaryotes.

Contenu

Voir table pour un contenu exhaustif.

Table des matières

Prof. Xavier De Bolle

1) La création de mutants chez des organismes simples

2) Tests d'interactions entre protéines

3) Applications du séquençage à haut débit (RNA-seq, ChIP-seq, Tn-seq, ...)

Prof. Thierry Arnould

1) Cytométrie de flux-FACS : principe et applications

2) Transfection de cellules de mammifères en culture : méthodes et approches, types de vecteurs, utilités et limitations,...

3) Invalidation d'expression de gènes par knock-down : siRNA et miRNA

Prof. Olivier De Backer

1) Introduction

2) Isolement et culture des cellules ES

3) Mutagenèse dirigée dans les cellules ES

4) Le système LoxP/Cre, ses variants et son utilisation pour modifier le génome

5) Les systèmes d'inactivation et d'expression inductible

6) Les banques de souris transgéniques Cre

7) Manipulation et transfert des embryons préimplantatoires (agrégation de morules, injection de blastocystes, embryons tétraploïdes)

 

Disciplines

Génétique moléculaire
Biochimie
Biologie cellulaire

Méthodes d'enseignement

Le programme établi en concertation avec les trois professeurs (Olivier De Backer, Xavier De Bolle,  et Thierry Arnould) couvre de nombreux aspects techniques et technologiques de la biologie moderne visant à donner des outils de lecture d'articles scientifiques et des clés conceptuelles nécessaires au « design » d'un programme de recherche scientifique. Les présentations magistrales utilisant divers outils didactiques (présentations sur transparents, vidéoprojection, tableau,...) seront complétées par des lectures critiques d'articles scientifiques.

Mode d'évaluation

En raison des mesures prises par le Conseil national de sécurité dans la lutte contre la propagation du covid-19 et de celles mises en place au niveau de l'UNamur, les modalités d'évaluation font l'objet de modification pour être adaptées à la situation. Les modalités d'évaluation qui sont ainsi d'application pour la période d'évaluation de fin de deuxième quadrimestre sont communiquées par l'enseignant, aux étudiants, via WebCampus pour chaque unité d'enseignement

L'étudiant tire au sort trois questions, chacune relative à la matière du cours magistral d'un des trois titulaires. Chaque enseignant corrige la partie qui le concerne. Préparation: l'étudiant prépare un cadre de réponse aux questions posées. Il dispose pour cela d'au moins 60 minutes. Quatre à cinq étudiants entrent dans la salle d'examen à chaque début de demi-journée d'interrogation. Sept à huit étudiants peuvent se trouver à préparer simultanément leur examen dans la même salle. L'étudiant est invité, le cas échéant, à faire part d'une difficulté éventuelle d'interprétation d'une question ou à solliciter une information ponctuelle oubliée dont il aurait besoin pour répondre. Interrogation orale: l'étudiant expose chacune de ses réponses au professeur concerné. Des questions subsidiaires interviennent en cours d'examen. La durée de l'examen oral est généralement comprise entre 20 et 30 minutes. Même pour les sous-questions posées oralement en cours d'examen, l'étudiant peut demander le temps de la réflexion. Une importance centrale est accordée à la qualité de la réflexion (compréhension des faits expérimentaux, interprétation des résultats) plutôt qu'à des détails factuels et de restitution. Il est attendu que l'étudiant réussisse chaque partie de cours pour être gratifié d'une réussite globale. Les trois enseignants discuteront ensemble des performances réalisées par l'étudiant et décideront ensemble si les objectifs sont atteints.

En cas d'échecs graves (note inférieure à 7/20) dans une ou plusieurs des 3 parties de ce cours, une note de 6/20 apparaitra sur la feuille de délibération. L'étudiant devra alors présenter en 2ème session la ou les matières concernées par l'échec, tout en conservant les notes déjà acquises en 1ère session pour les autres parties.

 

Sources, références et supports éventuels

Voir portail électronique (Webcampus) du site du cours et resources bibliographiques mises à disposition.

Langue d'enseignement

Français

Lieu de l'activité

NAMUR

Faculté organisatrice

Faculté des sciences
Rue de Bruxelles, 61
5000 NAMUR

Cycle

Etudes de 2ème cycle