Cours 2020-2021

Chimie médicale [MCHIB108]

  • 5 crédits
  • 39h+10h
  • 1er quadrimestre
Langue d'enseignement: Français

Acquis d'apprentissage

L’étudiant(e) devra développer et maîtriser les compétences suivantes : 

  • restitution de concepts théoriques de chimie ;
  • description qualitative et quantitative de la matière ;
  • représentation de molécule de (bio)molécules dans le plan et dans l’espace ;
  • résolution de problèmes quantitatifs ;
  • interprétation et construction de graphes

En particulier, au terme de son apprentissage, l’étudiant(e) sera en mesure :

  • de décrire la structure microscopique de la matière (niveau atomique et moléculaire) ;
  • de maitriser la nomenclature et la reconnaissance de groupements fonctionnels en chimie minérale et organique ;
  • de prédire les propriétés d’édifices moléculaires (bio)chimiques (géométrie, polarité, aromaticité, conformation, stéréochimie, configurations et chiralité)
  • d’utiliser la théorie des gaz parfaits en lien avec des problématiques médicales ;
  • de définir les propriétés des solutions (concentration, abaissement cryoscopique, conductivité, pH, …) ;
  • de décrire et pondérer des équations de réaction (dissociation, acide-base, redox, précipitation, complexation, combustion, …) ;
  • de réaliser des calculs de stœchiométrie 
  • de décrire l’état d’équilibre dynamique et son déplacement et de raisonner sur les constantes d'équilibres;
  • de prédire, à l’aide de concepts thermodynamiques, l'évolution de processus (bio)chimique ;
  • d’utiliser les concepts de cinétique pour décrire la vitesse de réactions enzymatiques ;
  • de décrire les grandes classes de réactions biochimiques et les mécanismes moléculaires sous-jacents ;
  • de décrire les principes de techniques de caractérisation et de (bio)spectroscopies

 

Objectifs

Ce cours a pour objectifs principaux de :

  • donner à l'étudiant une formation de base rigoureuse en chimie en lien avec des questions médicales ;
  • décrire la matière (corps purs ou mélanges) dans les trois niveaux de savoirs (macroscopique, microscopique et symbolique ;
  • décrire les molécules (bio)chimiques et en inférer des propriétés ;
  • expliquer et prévoir les transformations (bio)chimiques sur base de concepts de thermochimie et de cinétique et de l’analyse des transformations de groupes fonctionnels ;
  • solutionner des problèmes en utilisant les raisonnements et outils mathématiques ;
  • interpréter des données présentées sous différentes formes (tableau, graphique, texte, …)

 

Contenu

Le cours développe les théories de la chimie utiles aux applications médicales et biochimiques. La description de l'atome et la nature de la liaison chimique justifient la structure et la géométrie des (bio)molécules, et de leurs groupes fonctionnels, ainsi que les états de la matière. L’analyse conformationnelle de molécules organiques simples permet de comprendre les bases de la dynamique moléculaire. Cette description moléculaire explique l'activité pharmacologique de composés naturels et/ou de médicaments. La thermochimie et la cinétique permettent une description critique et quantitative de processus (bio)chimiques. L’analyse de transformations enzymatiques de groupes fonctionnels de biomolécules permet de comparer les grandes classes de réactions de la biochimie.

Des exemples en lien avec le domaine médical illustrent les concepts chimiques.

 

Table des matières

Les états de la matière

  • Mélanges, solutions, dispersions colloïdales (sang)
  • Forces intermoléculaires,
  • Etats solide et liquide : densité, miscibilité, tension de surface (capillaire, Laplace), tension de vapeur
  • Etat gazeux : pression, dissolution (Henry)

Atomes et molécules

  • Liaisons, géométrie (VSEPR), chiralité et stéréochimie (acides aminés, sucres, médicaments), conformation (folding de protéines, dynamique moléculaire de petites molécules organiques)
  • Nomenclatures des molécules minérales et organiques
  • Structure électronique – spectroscopies UV-vis (couleurs, absorption, fluorescence, Lambert-Beer) – aromaticité (biomolécules et médicaments)

Principes de thermochimie

  • Calorimétrie, spontanéité, équilibres et déplacement (KD, Ki, IC50)

Principes de cinétique

  • Cinétique enzymatique (michaélienne), inhibition

Réactions (bio)chimiques

  • Réactions acide-base : neutralisation et déplacement (cachet effervescent, détartrant et intoxication Cl2)
  • Acidité et pH : tampon, alcalose/acidose
  • Réactions redox : potentiel de réduction, cofacteurs (FAD, NAD), ponts SS, sucres réducteurs
  • Réactions de précipitation : agents de contraste (BaSO4)
  • Réactions de complexation : citrate (anticoagulant), EDTA
  • Réactions d'hydrolyse, de susbstitution, d'addition, d'élimination

 


Méthodes d'enseignement

Les modalités d'enseignement et d'évaluation des unités d'enseignement ont été rédigées en fonction de la situation à la rentrée académique 2020-2021. Cependant, ces modalités pourraient faire l'objet de modifications en fonction de l'évolution de la crise sanitaire liée à la covid-19. Les étudiants seront informés de toute modification de la situation générale (passage à l'enseignement à distance partiel ou complet) par les autorités de l'UNamur tandis que les modifications propres à chaque unité d'enseignement leur seront communiquées par les enseignants, via webcampus

Pour ce cours, différentes pédagogies seront abordées :

  • Cours magistraux pour la théorie (y compris classe-inversée) ;
  • Séances d’exercices encadrées par des assistants ;
  • Accès à une plateforme informatique d'auto-apprentissage et d'auto-évaluation ;
  • Mise à disposition de vidéos et supports graphiques accessibles sur le web.
  • Aide en groupe via l'organisation de séances Tremplin
  • Aide personnalisée via la cellule didactique du département de chimie

 

Mode d'évaluation

Les modalités d'enseignement et d'évaluation des unités d'enseignement ont été rédigées en fonction de la situation à la rentrée académique 2020-2021. Cependant, ces modalités pourraient faire l'objet de modifications en fonction de l'évolution de la crise sanitaire liée à la covid-19. Les étudiants seront informés de toute modification de la situation générale (passage à l'enseignement à distance partiel ou complet) par les autorités de l'UNamur tandis que les modifications propres à chaque unité d'enseignement leur seront communiquées par les enseignants, via webcampus

Une évaluation formative est réalisée via des exercices sur le web.

L'évaluation certificative de l'unité d'apprentissage se base sur un examen écrit qui reprend des questions de type QCM, et la résolution de problèmes tels que ceux travaillés au cours des séances de Travaux Dirigés (TD).

 

Sources, références et supports éventuels

Manuel "Concentré de CHIMIE", seconde édition (Presses Universitaires de Namur)

site web: concentre-chimie.unamur.be

webcampus : compléments de notes de cours; exercices d'autoévaluation

Langue d'enseignement

Français

Lieu de l'activité

NAMUR

Faculté organisatrice

Faculté de médecine
rue de Bruxelles
61
5000 NAMUR
T. 081724347
F. 081724327
administration-medecine@unamur.be

Cycle

Etudes de 1er cycle
BlocCrédits
Bachelier en médecine15