Introduction to programming [ISBMM101]

Acquis d'apprentissage

• Comprendre le concept de « langage de programmation »
• Connaître et comprendre les concepts de la programmation dans le cadre du langage Python . Une attention particulière est apportée aux fonctionnalités fréquemment utilisée dans le cadre de la biologie et la bio-informatique. Celles-ci comprennent :
• Les variables et les valeurs (types natifs, chaînes de caractères)
• Les manipulations de chaînes de caractères et les expressions régulières 
• Les structures de données
• Les structures de contrôle
• Les fonctions, la récursivité et les fonctions d’ordre supérieur
• Les tests
• Les entrées/sorties et la manipulation de fichiers
• Les générateurs et itérateurs
• Les classes, attributs et méthodes
• La gestion des exceptions
• Connaître et comprendre les principales caractéristiques des paradigmes de programmation (impératif, fonctionnel, objet) et comment certaines de celles-ci sont présentes au sein du langage Python
• Être en mesure d’élaborer des algorithmes de façon correcte et rigoureuse permettant de résoudre des problème simples, et d’implémenter ces algorithmes en Python.

Objectifs

Ce cours offre une introduction à la programmation logicielle et à l’ensemble de ses concepts, en axant la matière, les exemples et les exercices vers un usage adapté aux besoins en biologie. Il vise à acquérir une maîtrise pratique de ces concepts via l’utilisation du langage Python.
 

Contenu

• Introduction
• Variables et types de valeurs
• Manipulation de texte
• Lecture et écriture de fichiers
• Les listes et les boucles
• Les fonctions et le testing
• Les structures conditionnelles
• Les expressions régulières
• Les dictionnaires
• Le programme et ses entrées/sorties
• La récursivité
• Les structures de données complexes
• La programmation orientée objet
• La programmation fonctionnelle
• Les itérateurs et générateurs
• La gestion des exceptions

Description des exercices

Les séances d’exercices suivront fidèlement l’avancement du cours théorique. Il seront dispensés sur ordinateur afin d’offrir à l’étudiant les outils et les bonnes pratiques lui permettant de faire une utilisation concrète de Python. Certaines préparations à domicile peuvent être demandées.